शोध सारांश

प्रयोगशाला के प्रमुख शोध मुख्य बिंदु

प्रारंभिक अध्ययन जंगली प्रतिरोधी पाइपर प्रजाति पाइपर कोलुब्रिनम से उम्मीदवार रक्षा संबंधी जीन की पहचान करने और इस गैर-मॉडल पौधे में जीन कार्यात्मक अध्ययन के लिए उपयुक्त आणविक प्लेटफार्मों के अनुकूलन पर केंद्रित थे। अध्ययन के मुख्य बिंदु इस प्रकार हैं:

• सप्रेशन सब्रेक्टिव हाइब्रिडाइजेशन (SSH) दृष्टिकोण द्वारा P.capsici प्रतिरोधी जंगली मिर्च-Piper colubrinum से उम्मीदवार रक्षा जीन की पहचान (डिक्टो और मंजुला, 2005.
• प्रोटीन स्तर अभिव्यक्ति और डाउनस्ट्रीम कार्यात्मक परख द्वारा रक्षा जीन कार्यात्मक सत्यापन (मणि और मंजुला 2010; मणि और मंजुला 2011.
• हेयरपिन RNAi और VIGS रणनीति द्वारा Piper colubrinum में जीन साइलेंसिंग प्लेटफ़ॉर्म का अनुकूलन (मणि एट अल, 2012; अनु एट अल 2015a, अनु एट अल 2015b).

प्रयोगशाला का वर्तमान फोकस

महत्वपूर्ण मसाला फसल पाइपर निग्रम (काली मिर्च) में हमारा चल रहा काम मोटे तौर पर उन विशिष्ट आणविक घटकों की पहचान करना है जो रोगजनक (फाइटोफ्थोरा कैप्सिसी) के साथ बातचीत के दौरान पौधे की सहज प्रतिरक्षा को बढ़ावा देते हैं। अध्ययन के कुछ मुख्य बिंदु इस प्रकार हैं:

• काली मिर्च में आवश्यक आणविक जानकारी के अभाव में, हमने पी.निग्रम एक्स पी.कैप्सिसि परस्परक्रिया से जुड़े आणविक परिवर्तनों को प्राप्त करने और समझने के लिए एक सरल और एकीकृत ‘ओमिक्स’ दृष्टिकोण का उपयोग किया है। (महादेवन एट अल, 2016.
• हमारा अध्ययन पी.कैप्सिसि संक्रमण के जवाब में काली मिर्च में नवीन प्रोटिओमिक्स जानकारी की पहचान, विशेषता और मात्रा निर्धारित करने वाला पहला अध्ययन है, जिसे हमारे ट्रांसक्रिप्ट स्तर अभिव्यक्ति डेटा के प्रकाश में आगे मान्य किया गया था।
• संभावित प्राइमिंग लक्ष्यों की पहचान की गई है, और इनका कार्यात्मक रूप से qRT-PCR विश्लेषण और वायरस-प्रेरित जीन साइलेंसिंग (VIGS)/ ओवरएक्सप्रेशन दृष्टिकोणों द्वारा ट्रांसक्रिप्ट स्तर पर मूल्यांकन किया जा रहा है।

महत्वपूर्ण उपलब्धियाँ

• प्रमुख मसाला फसल में रोगजनक संक्रमण के विभिन्न समय बिंदुओं पर एनोटेटेड ट्रांसक्रिप्टोम और प्रोटिओम डेटाबेस का निर्माण पाइपर निग्रम (एनसीबीआई एसआरए में प्रस्तुत ट्रांसक्रिप्टोम डेटा; प्रोटिओम डेटा पहचानकर्ता PXD003887 के साथ प्रोटिओमएक्सचेंज के माध्यम से उपलब्ध है)।
• पाइपर निग्रम में कुछ संभावित 'प्राइमिंग' लक्ष्यों की पहचान की गई है (और पाइपलाइन में हैं), जो काली मिर्च में फसल सुरक्षा रणनीति के रूप में 'प्राइमिंग' विकसित करने के लिए उपयोगी संसाधन हैं।
• रक्षा जीन कार्यात्मक अध्ययनों के लिए क्रमशः पाइपर एसपी और मॉडल पौधों (निकोटियाना एसपी और अरबीडोप्सिस थालियाना) में वीआईजीएस द्वारा जीन साइलेंसिंग और ओवर एक्सप्रेशन रणनीतियों सहित अनुकूलित आणविक प्लेटफ़ॉर्म।

Title of projects (last 5 years)

• पाइपर कोलुब्रिनम से रक्षा संबंधी जीनों के कार्यात्मक सत्यापन के लिए आरएनएआई विधियाँ
• तम्बाकू में मानव पुनः संयोजक ग्रैनुलोसाइट कॉलोनी उत्तेजक कारक उत्पादन का अनुकूलन।
• सेंटेला एशियाटिका और पिरिफॉर्मोस्पोरा इंडिका की पारस्परिक अंतःक्रिया का आणविक विश्लेषण और द्वितीयक मेटाबोलाइट उत्पादन पर इसका प्रभाव।
• पाइपर नाइग्रम - फाइटोफ्थोरा कैप्सिसी फाइटोपैथोसिस्टम में रोगजनक संबद्ध आणविक पैटर्न (पीएएमपी) ट्रिगर प्रतिरक्षा का आणविक विश्लेषण।