आरजीसीबी में डीबीटी-सहज राष्ट्रीय सुविधा मास स्पेक्ट्रोमेट्री का उपयोग करके मेटाबोलाइट्स और लिपिड के चयनित समूहों की मात्रा निर्धारित करने के लिए बड़ी संख्या में लक्षित पैनल स्थापित करने की प्रक्रिया में है। ये लक्षित पैनल उपलब्ध मानकों का उपयोग करके विश्लेषकों के एक केंद्रित समूह की सटीक पूर्ण मात्रा निर्धारित करते हैं।
लक्षित मेटाबोलोमिक्स या लिपिडोमिक्स एक मात्रात्मक दृष्टिकोण है जिसमें मेटाबोलाइट्स के एक ज्ञात सेट को 13C, 2H या 15N आइसोटोप-लेबल वाले आंतरिक या बाहरी संदर्भ यौगिकों का उपयोग करके मात्रा निर्धारित की जाती है। परिणामी डेटा का उपयोग सांख्यिकीय विश्लेषण के लिए इनपुट चर के रूप में किया जा सकता है।
इस सुविधा का लक्ष्य 300 से अधिक लिपिड अणुओं/प्रजातियों का एक पैनल स्थापित करना है, जो तालिका-1 में दिखाए गए अनुसार 25 प्रमुख लिपिड वर्गों के अंतर्गत आता है।
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तालिका-1. लक्षित लिपिडोमिक्स के लिए लिपिड वर्गों के पैनल स्थापित किए जा रहे हैं |
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| एस.एन. | लिपिड वर्ग | एस.एन. | लिपिड वर्ग |
| 1 | GM3 गैंग्लियोसाइड (GM) | 14 | फॉस्फेटिडिलग्लिसरॉल (PG) |
| 2 | स्फिंगोमाइलिन (SM) | 15 | कोलेस्ट्रॉल एस्टर (CE) |
| 3 | फॉस्फेटिडिलकोलाइन (PC) | 16 | मुक्त कोलेस्ट्रॉल (COH) |
| 4 | एल्काइल फॉस्फेटिडिलकोलाइन [PC(O)] | 17 | DG |
| 5 | फॉस्फेटिडिलकोलाइन प्लाज़्मालोजेन [पीसी(पी)] | 18 | TG |
| 6 | लाइसोफॉस्फेटिडिलकोलाइन (LPC) | 19 | कार्निटाइन |
| 7 | लाइसोएल्किलफॉस्फेटिडिलकोलाइन [LPC(O)] | 20 | फैटी एसिड |
| 8 | फॉस्फेटिडाइलेथेनॉलमाइन (पीई) | 21 | डाइहाइड्रोसेरामाइड (dhCer) |
| 9 | एल्काइल फॉस्फेटिडाइलेथेनॉलमाइन [पीई(ओ)] | 22 | सेरामाइड (Cer) |
| 10 | फॉस्फेटिडाइलेथेनॉलमाइन प्लाज़्मालोजेन [PE(P)] | 23 | मोनोहेक्सोसिलसेरामाइड (MHC) |
| 11 | लाइसोफोस्फेटिडाइलेथेनॉलमाइन (LPE) | 24 | डाइहेक्सोसिलसेरामाइड (DHC) |
| 12 | फॉस्फेटिडिलिनोसिटॉल (PI) | 25 | ट्राइहेक्सोसिलसेरामाइड (THC) |
| 13 | फॉस्फेटिडिलसेरिन (PS) | ||
फिलहाल हमारे पैनल में 36 लिपिड अणु शामिल हैं, जो 13 लिपिड वर्गों और एक कार्बन मेटाबोलिज्म के 2 मेटाबोलाइट्स के अंतर्गत आते हैं। उपलब्ध पैनल की सूची नीचे तालिका-2 और तालिका-3 में दी गई है। ये पैनल हमारी सुविधा में केस-दर-केस आधार पर जांचकर्ताओं की शोध आवश्यकताओं को पूरा करने के लिए स्थापित किए जा रहे हैं।
जो जांचकर्ता नीचे सूचीबद्ध नहीं किए गए मेटाबोलाइट्स या लिपिड को मापने में रुचि रखते हैं, उन्हें विधि स्थापित करने की संभावनाओं पर चर्चा करने के लिए सुविधा प्रभारी से संपर्क करना चाहिए।
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तालिका – 2. लक्षित लिपिडोमिक्स के लिए उपलब्ध स्थापित लिपिड पैनल |
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| क्रमांक | लिपिड वर्ग | अणु/प्रजाति | पूर्वगामी (m/z) | उत्पाद (m/z) | आंतरिक मानक (20 pMol) |
| 1 | सेरामाइड | C14:0 | 510.6 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड |
| 2 | C16:0 | 538.7 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 3 | C18:0 | 566.7 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 4 | C18:1 | 564.7 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 5 | C22:0 | 622.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 6 | C24:0 | 650.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 7 | C24:1 | 648.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 8 | C25:0 | 664.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 9 | C26:0 | 658.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 10 | C26:1 | 642.9 | 264.249 | C12:0 सेरामाइड | |
| 11 | डाइहाइड्रो-सेरामाइड | C16:0 | 540.7 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड |
| 12 | C18:0 | 568.7 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड | |
| 13 | C24:1 | 650.9 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड | |
| 14 | C24:0 | 652.9 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड | |
| 15 | सेरामाइड-1-फॉस्फेट | C16:0 | 618.7 | 264.4 | C12:0 सेरामाइड-1-फॉस्फेट |
| 16 | C24:0 | 730.9 | 264.4 | C12:0 सेरामाइड-1-फॉस्फेट | |
| 17 | डाइहाइड्रोसेरामाइड-1-फॉस्फेट | C12:0 | 564.6 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड-1-फॉस्फेट |
| 18 | C24:0 | 732.9 | 266.4 | C12:0 सेरामाइड-1-फॉस्फेट | |
| 19 | लैक्टोसिल सेरामाइड | C16:0 | 862.7 | 264.4 | C12:0 लैक्टोसिल(β) सेरामाइड |
| 20 | C24:0 | 974.9 | 264.4 | C12:0 लैक्टोसिल(β) सेरामाइड | |
| 21 | ग्लूकोसिल सेरामाइड | C16:0 | 700.7 | 264.249 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड |
| 22 | C18:0 | 728.7 | 264.249 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड | |
| 23 | C24:1 | 810.9 | 264.249 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड | |
| 24 | डाइहाइड्रोग्लूकोसिल सेरामाइड | C12:0 | 646.6 | 266.6 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड |
| 25 | C16:0 | 702.7 | 266.6 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड | |
| 26 | C18:0 | 730.7 | 266.6 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड | |
| 27 | C24:0 | 814.9 | 266.6 | C12:0 ग्लूकोसिल(β) सेरामाइड | |
| 28 | स्फिंगोमाइलिन | C18:0 | 731.8 | 184.4 | C12:0 स्फिंगोमाइलिन |
| 29 | C24:0 | 815.9 | 184.4 | C12:0 स्फिंगोमाइलिन | |
| 30 | डाइहाइड्रोस्फिंगोमाइलिन | C12:0 | 649.7 | 184.4 | C12:0 स्फिंगोमाइलिन |
| 31 | C18:0 | 733.8 | 184.4 | C12:0 स्फिंगोमाइलिन | |
| 32 | C24:0 | 817.9 | 184.4 | C12:0 स्फिंगोमाइलिन | |
| 33 | स्फिंगोसिन | C18:1 | 300.4 | 264.4 | C17 स्फिंगोसिन |
| 34 | स्फिंगैनिन | C18:0 | 302.4 | 266.4 | C17 स्फिंगैनिन |
| 35 | स्फिंगोसिन-1 फॉस्फेट | C18:1 | 380.4 | 264.4 | C17 स्फिंगोसिन-1 फॉस्फेट |
| 36 | स्फिंगैनिन-1-फॉस्फेट | C18:0 | 382.4 | 266.4 | C17 स्फिंगैनिन-1-फॉस्फेट |
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तालिका – 3. लक्षित मेटाबोलोमिक्स के लिए उपलब्ध स्थापित मेटाबोलाइट पैनल |
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| मेटाबोलाइट | प्रीकर्सर (m/z) | उत्पाद (m/z) | आंतरिक मानक | |
| 1 | मिथाइलमेलोनिक एसिड (MMA) | 117.1 | 73.125 | MMA-D |
| 117.1 | 55.071 | MMA-D | ||
| 2 | होमोसिस्टीन (Hcy) | 136.043 | 55.883 | Hcy-D |
| 136.043 | 89.883 | Hcy-D | ||
अंतिम बार अद्यतन किया गया: January 10, 2025
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