यूकेरियोटिक mRNA को 3'-अंत में दो-चरणीय घटना में संसाधित किया जाता है: एक एंडोन्यूक्लियोलाइटिक दरार जिसके बाद पॉली (ए) पॉलीमरेज़ (पीएपी) द्वारा एडेनोसिन पूंछ को जोड़ा जाता है। स्टार-पीएपी और पीएपीए/? नाभिक में दो प्राथमिक पीएपी हैं जो mRNA के परमाणु पॉलीएडेनिलेशन में शामिल हैं। जबकि दो पीएपी समान प्रसंस्करण कारकों को साझा करते हैं, वे लक्ष्य mRNA के अलग-अलग स्थान को विनियमित करते हैं। इसके अलावा, 70% से अधिक मानव जीन (APA) में 3'-अंत में कई साइटों पर पॉलीएडेनिलेशन वैकल्पिक रूप से होता है, जो विभिन्न लंबाई वाले mRNA आइसोफॉर्म को एन्कोड करता है जो जीन अभिव्यक्ति को नियंत्रित करता है। हम इस क्रियाविधि को परिभाषित करने में रुचि रखते हैं कि विभिन्न PAP कैसे लक्ष्य mRNA का चयन करते हैं और ये लक्ष्य प्रत्येक PAP के लिए कैसे अनन्य हैं। हम अनुवादोत्तर संशोधन द्वारा PAP विशिष्टता के विनियमन का भी अध्ययन करते हैं, और कैसे UTR विशिष्टता वैकल्पिक पॉलीएडेनिलीकरण को नियंत्रित करती है।

आरएनए बाइंडिंग मोटिफ प्रोटीन 10 (आरबीएम10) एपोप्टोटिक जीन के वैकल्पिक स्प्लिसिंग का एक नियामक है। हमने आरबीएम10 के एक स्प्लिसिंग स्वतंत्र कार्य की पहचान की है जो हृदय में हाइपरट्रॉफी और हृदय विफलता में हृदय जीन के mRNA 3'-एंड प्रसंस्करण को नियंत्रित करता है। हम इस बात में रुचि रखते हैं कि आरबीएम10 हृदय हाइपरट्रॉफी और हृदय विफलता को कैसे नियंत्रित करता है और विनियमन में शामिल सिग्नलिंग मार्ग क्या हैं। हम हृदय विफलता में हृदय जीन अभिव्यक्ति के विनियमन में आरबीएम10 में फॉस्फोराइलेशन जैसे अनुवादोत्तर संशोधनों का भी अध्ययन करते हैं।

हमने बताया है कि अधिकांश लंबे गैर-कोडिंग RNA (LncRNAs) को स्टार-PAP द्वारा संसाधित या विनियमित किया जाता है। जबकि अधिकांश LncRNAs पॉलीएडेनिलेटेड होते हैं, कुछ में संशोधित 3'-छोर होता है। दिलचस्प बात यह है कि स्टार-PAP द्वारा लक्षित अधिकांश mRNAs/lncRNAs कैंसर मेटास्टेसिस (CM) और मधुमेह (DM) जैसे चयापचय रोगों से जुड़े होते हैं। प्रारंभिक अवलोकन विभिन्न रोग स्थितियों के तहत mRNAs और lncRNAs के बीच विभिन्न प्रसंस्करण पैटर्न का सुझाव देते हैं। इसके अलावा CM और DM में अलग-अलग स्टार-PAP स्तर की सूचना दी गई है। हम mRNA और lncRNA प्रसंस्करण के तंत्र

पॉली (ए) टेल्स न केवल यूकेरियोटिक mRNA 3'-एंड पर मौजूद हैं, बल्कि कुछ बैक्टीरियल mRNAs पर भी मौजूद हैं। जबकि पॉलीएडेनिलेशन यूकेरियोट्स में mRNA को स्थिर करता है, पॉली (ए) टेल की उपस्थिति बैक्टीरियल mRNA के क्षरण को चिह्नित करती है। हालांकि, कार्यात्मक अंतर के लिए सटीक तंत्र ज्ञात नहीं है। यहां, हमारा उद्देश्य दो जीवों के बीच mRNA स्थिरता के मूल तंत्र को परिभाषित करना और यह निर्धारित करना है कि दो पॉलीएडेनिलेशन और स्थिरीकरण मार्गों को क्या जोड़ता है। हमारा ट्रांसक्रिप्टोमिक्स डेटा तनाव प्रतिक्रिया, बैक्टीरियल रोगजनन और पोषक तत्वों की कमी में पॉलीएडेनिलेशन पर निर्भर mRNA स्थिरीकरण की संभावित भूमिका का दृढ़ता से सुझाव देता है।

लिपोटॉक्सिसिटी एक चयापचय विकार है जो लिपिड सिग्नलिंग मार्गों के अति-सक्रियण के परिणामस्वरूप होता है, जिससे कोशिकाओं में लिपिड मध्यवर्ती पदार्थों का संचय होता है, जिससे सेलुलर संकट होता है और अंततः लिपोएपोप्टोसिस होता है। हृदय प्रमुख रूप से प्रभावित अंगों में से एक है क्योंकि इसके कामकाज के लिए उच्च कैलोरी की आवश्यकता होती है और इसकी आवश्यकताओं को पूरा करने के लिए फैटी एसिड (FAs) का व्यापक ऑक्सीकरण होता है। इस सुचारु रूप से विनियमित नेटवर्क में कोई भी गड़बड़ी कार्डियक लिपोटॉक्सिसिटी का कारण बनेगी, जिसके परिणामस्वरूप हृदय संबंधी शिथिलता और हृदय गति रुकना होगा। प्रयोगशाला में किए गए प्रारंभिक अध्ययनों से पता चला है कि लिपिड चयापचय में शामिल अधिकांश जीन और lncRNAs फॉस्फोइनोसाइटाइड (PI) सिग्नलिंग के माध्यम से मध्यस्थता वाले 3?-एंड mRNA प्रसंस्करण द्वारा संशोधित होते हैं। हमारा उद्देश्य लिपिड संरचना को प्रभावित करने वाले लिपिड मेटाबोलाइजिंग जीन के पोस्ट-ट्रांसक्रिप्शनल विनियमन और लिपोटॉक्सिक तनाव के दौरान PI सिग्नलिंग पर प्रभाव को समझना है।